醫院污水中含有一些特殊的污染物，如藥物、消毒劑、診斷用劑、洗滌劑，以及大量病原性微生物、寄生蟲卵及各種病毒。
    目前，醫療污水處理設備醫療廢水的處理工藝，主要由一級沉淀消毒處理和二級生化消毒處理工藝。醫療污水處理設備具體處理工藝可根據出水要求進行選擇。當處理廢水可排入城市污水管網時，采用一級處理，要求直接排放時，采用二級處理工藝。當采用一級處理流程時，醫院污水應與職工生活區污水、雨水分流，僅對醫院污水進行消毒處理；當采用二級或深度處理流程時，根據需要，職工生活區污水可與醫院污水河流進行處理，但廚房用水必須設隔油井（池）。醫療污水處理設備根據醫院污水的特點，一般采用先進成熟的“厭氧水解+生物接觸氧化+消毒”的工藝。
    厭氧水解和生物接觸氧化工藝的結合使用能使污水中的有機物得到較大限度的降解，二氧化氯消毒系統則讓污水的毒性大大降低至安全值以下。傳染病醫療機構和結核病醫療機構污水處理宜采用二級處理+消毒工藝（或深度處理+消毒工藝）；綜合醫療機構污水排放執行排標準時，醫療污水處理設備宜采用二級處理+消毒工藝（或深度處理+消毒工藝），執行預處理標準時宜采用一級處理或一級強化處理+消毒工乙。
工藝介紹:
    醫院污水中除了含有各種病菌、病毒和寄生蟲卵以外，還含有許多無機物和有機物，如各種藥物、消毒劑、用于診斷和治療的放射性同素等。國此，對醫院污水的處理，既要考慮消毒殺菌的衛生龍活虎指標也應兼顧CODcr、BOD5等環保指標。
工藝流程：
污水→一經預處理→收集→二級預處理→三級消毒處理→達標排放
  一級預處理設備施主要有化糞池、格柵等，可去除污水中大顆粒懸浮物，防止其危害后續處理設施。二級預處理采用兼氧+好氧（A/0）n工藝，是用生物化學的方法除污水中溶解的膠狀有機物，可確保污水COD和BOD指標達標排放。同時由于該段去除了大部分有機物和細小懸浮物，因此，可極大地提高消毒效率，降低后續消毒劑的用量，節約運行成本。兼性+好氧（A/0）n工藝為我公司的生物處理技術，已經被評為國家重點環境保護實用的技術。接觸消毒池主要是殺滅污水中各種病菌、病毒和寄生蟲，接觸消毒系統可采用NaC102器和C102器，較其它消毒系統，具有安全可靠、操作簡單、可穩定地達到衛生和環保各項指標的要求，同時具有投資省、運行費用低、操作簡單、管理方便等優點。